La Fédération des Jeunes et Etudiants chrétiens Francophones comprend les services permanents suivants, placés sous la responsabilité du secrétaire général :
Le service information, communication et documentation
Le service radio
Le service des relations œcuméniques
Le service d'aumônerie aux armées
Le service biblique
Service pour les relations avec les musulmans
Le service justice et aumônerie des prisons (ministère de prison)
